一、派驻机构
莆田市纪委监委驻市公安局纪检监察组
二、内设机构
（一）警务督察支队
（二）办公室
（三）政治部
（四）机关党委
（五）警务保障处
（六）指挥情报中心
（七）监所管理支队
（八）出入境管理支队（下设湄洲岛口岸签证处）
（九）监察协作勤务支队
（十）户政管理处
（十一）信通处
（十二）法制支队
（十三）打击走私工作处
三、直属机构
（一）刑事侦查支队
（二）巡特警支队
（三）经济犯罪侦查支队
（四）治安支队
（五）禁毒支队
（六）交通警察支队
（七）海防支队
（八）森林警察支队
四、基层单位
（一）莆田市第一看守所
（二）莆田市第二看守所
（三）莆田市第三看守所
（四）莆田市拘留所
（五）莆田市强制戒毒所
五、下属事业单位
莆田市公安局文职人员中心
六、派出机构
荔城分局、城厢分局、涵江分局、秀屿分局和北岸分局等5个分局